Повторное молекулярное тестирование на COVID-19
Повторное молекулярное тестирование на COVID-19: корреляция с появлением инфекционного вируса, пороговые значения циклов и аналитическая чувствительность.
Repeat COVID-19 Molecular Testing: Correlation with Recovery of Infectious Virus, Molecular Assay Cycle Thresholds, and Analytical Sensitivity. Victoria Gniazdowski, C. Paul Morris, Shirlee Wohl, Thomas Mehoke, Srividya Ramakrishnan, Peter Thielen, Harrison Powell, Brendan D Smith, Derek T Armstrong, Monica Herrera, Carolyn Reifsnyder, Maria Sevdali, Karen C Carroll, Andrew Pekosz, Heba H Mostafa. medRxiv 2020.08.05.20168963; doi: https://doi.org/10.1101/2020.08.05.20168963
Повторное молекулярное тестирование на SARS-CoV-2 может привести к сценариям, включающим несколько положительных результатов, положительные результаты после отрицательных тестов и повторяющиеся ложноотрицательные результаты у лиц с симптомами.
Последовательно собранные образцы из ретроспективной когорты (пациенты с COVID-19 в больнице Джона Хопкинса) были оценены на предмет распространения РНК и инфекционного вируса. Полногеномное секвенирование подтвердило генотип вируса у пациентов с длительным выделением вирусной РНК. Была использована droplet-digital PCR (ddPCR), чтобы оценить частоту ложноотрицательных результатов стандартной ПЦР. Появление инфекционного вируса было связано со значением Ct 18,8 ± 3,4. Длительное выделение вирусной РНК было связано с нахождением инфекционного вируса в образцах, собранных в течение 20 дней после первого положительного результата у пациентов, у которых на момент сбора образцов отсутствовали симптомы. Использование значений Ct и клинических симптомов обеспечивает более точную оценку возможности распространения инфекционного вируса.
